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广西壮族自治区南溪山医院(广西壮族自治区第二人民医院) 胃癌微环境单细胞组学研究服务院内议价公告

发布时间:2025-08-10 08:38 本文来源: 招标办

广西壮族自治区南溪山医院(广西壮族自治区第二人民医院)

                                                                 胃癌微环境单细胞组学研究服务院议价公告

我院拟对胃癌微环境单细胞组学研究服务进行采购,欢迎具有相应资质的单位前来报名。现将有关事项告知如下:

一、项目名称:南溪山医院胃癌微环境单细胞组学研究服务

二、项目编号:NYZBB-ZWK-2025026

、报名资料要求:

1.营业执照复印件;

2.法定代表人身份证明或法人授权委托书及被授权人身份证明和联系方式;

3.所有报名资料需加盖单位公章。

四、采购需求:

(一)项目要求

1.供应商拥有自己算力及服务器平台提供购买证明或研发证明

2.供应商拥有数据分析的全自动平台,避免人为因素的影响,显著提高数据的可靠性和一致性。

3.供应商提供不少于1年期的售后服务。

(二)项目目标

技术指标1:甲方提供样品,乙方负责完成12个样本细胞悬液制备、10xgenomics平台单细胞转录组测序,每个样品数据量满足100G。

技术指标2:甲方主导文献调研,乙方配合文献调研,甲乙双方共同讨论明确分析思路。

技术指标3:基于本项目的数据,甲方负责提出分析需求(分析内容包括本次检测的单细胞数据以及前期的空间蛋白质组数据),乙方负责分析实现。根据课题和文章的需要,甲乙双方分工合作进行结果梳理和故事挖掘。

分析内容如下:

单细胞转录组

信息分析内容细分条目

基本质控

1.去除低质量reads、去除接头、 计算测序错误率、统计 Q20、 Q30、GC含量;

2.进行基本的质量统计分析;

基础分析

3.有效Barcode统计,测序饱和度统计;

4.基本数据分析,细胞数目统计,单个细胞reads数目统计等;

5.基因表达定量,获得表达基因及其表达量数据;

6.聚类分析,提供tSNE聚类分析结果;

7.差异基因分析,针对不同cluster 中的基因进行差异分析。

高级分析

8. 差异基因功能富集,包括GO和KEGG;

9. marker基因筛选。

 

空间蛋白质组

信息分析内容细分条目

特征提取与定量分析

1.蛋白质/肽段定位:通过质谱成像的m/z峰匹配数据库鉴定蛋白质;通过荧光图像的斑点检测定位目标蛋白。

2.定量分析:计算蛋白质的空间丰度、分布密度,或通过统计检验,比较不同区域的差异表达。

空间关联分析

3.共定位分析:通过图像配准或多重荧光标记,计算目标蛋白与其他标记物的空间重叠度,揭示蛋白质的组织微环境定位。

4.空间聚类:利用空间统计方法或机器学习识别蛋白质的空间聚类模式,对应特定功能区域。

功能与机制注释

5.功能富集:结合GO、KEGG通路、Reactome等数据库,对差异定位的蛋白质进行功能富集分析,关联其生物学过程。

6.亚细胞定位预测:通过工具预测蛋白质的理论亚细胞定位,并与实验空间数据验证,解析其在特定细胞器的动态分布。

7.疾病关联:在疾病样本中,分析致病蛋白的异常空间定位,关联病理表型。

多组学整合分析

8.将空间蛋白质组数据与单细胞测序数据整合,构建“基因表达-蛋白质定位-功能表型”的多维度调控网络。

备注:以上分析内容只是基础分析,为了更好地满足本项目的研究目的,在甲乙双方调研和讨论的基础上,乙方需要进一步调整分析方法、内容和结果。

五、报价要求:报价为包干报价请供应商自行考虑成本,医院不再支付其他费用

六、投标所需文件:

请有意向的投标公司报名后准备相关文件文件应含有但不限于以下内容:营业执照、相关资质、法定代表人身份证复印件、法人授权委托书原件(授权委托时须提供)、授权委托代理人身份证(授权委托时须提供)、项目报价、服务方案相关证明材料、三年内类似业绩(以中标、成交通知书或签订的服务合同为准)、售后服务承诺、联系人及电话等。参会资料正本一份,副本份,所提交的投标资料恕不退回。请按要求准备投标文件,如未按要求提供资料,视为不能响应需求。

报名却无故不参会者,视为不诚信供应商,一年内不准参与我院任何的采购会议。

报名方法:报名资料加盖公章后以PDF文件发至招投标管理办公室邮箱nyztbglbgs@163.com)。邮件标题“投标项目名称--投标人名称--被授权人姓名--联系方式”,邮件内附件标题需与邮件标题一致,报名材料须含授权委托代理人手机联系方式。

八、联系人:  蔡老师    电话:0773-7592156

九、报名及递交材料时间:2025年8月10日~2025年8月15日下午5:00,逾期不予受理。请在报名后将参会资料密封(密封面上标明“投标项目名称--投标公司名称--被授权人姓名--联系方式”),并在规定的时间内(2025年8月15日下午5:00前)递交或邮寄至广西壮族自治区南溪山医院招投标管理办公室(桂林市象山区崇信路46号南溪山医院家属区18栋1楼)。

 

                                   广西壮族自治区南溪山医院

(广西壮族自治区第二人民医院)

                                      2025810

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